تتولى وحدة البحث والتطوير في المراكز الصناعية مسؤولية شرح الأهداف والمهام الرئيسية وتوفير التخطيط الاستراتيجي (الزماني والمكاني والمالي والقوى البشرية) لتحقيقها وتصميم العمليات التنفيذية وتحسينها ووضع خطط قصيرة ومتوسطة وطويلة المدى لتطوير الخدمات و أداء الشؤون التنموية وتنسيق المشاريع وكذلك تخطيط المعلومات. التغيير في احتياجات وأذواق العملاء، والنمو التكنولوجي السريع، والمنافسة مع الشركات الوطنية والدولية لجذب السوق، وكذلك التراجع التدريجي والركود في النظريات والأفكار داخل المنظمة يتطلب أن تكون الشركة في شكل نظام إدارة قوي وفعال دائمًا فكر في تحسين العمليات المتاحة وتحديثها وتوسيعها وإنشاء مسارات عمل جديدة.

بعض الخطط التي تم تنفيذها في وحدة البحث والتطوير بمعهد بونيان خلال فترة نشاط الشركة هي كما يلي:

وضع الخطط الاستراتيجية وتحديد الاستراتيجيات الرئيسية وقصيرة المدى.
الحصول على معايير التصميم والتنفيذ من منظمات المعايير العالمية وتقييم المنتجات على أساس نسبة الانحراف عن المعايير.
تنفيذ وتوثيق المهام والخطط القائمة على البحث والتطوير في مجال جمع وبحث المعلومات المطلوبة لإنتاج منتجات صناعة المياه والصرف الصحي، وتحديد الاستراتيجيات الجديدة بسبب تنظيم مشاريع الشركة، وإعداد فريق العمل وإعداد التقارير.
إجراء البحوث والدراسات على المشاريع السابقة والأبحاث المطلوبة في العيوب الحالية نحو تطوير المنتجات المستقبلية وتحسينها.
إجراء أبحاث حول زيادة تنوع المنتجات والخدمات.
التعاون مع المعاهد العلمية والبحثية.
تحديد الأسواق المستهدفة داخل الدولة وخارجها.